Проект по изучению средовой ДНК (eDNA) в парках и на   особо охраняемых зеленых территориях действует в Москве с 2025 года. Его ведут ученые Института проблем экологии и эволюции имени А. Н. Северцова РАН и Департамент природопользования.

Специалисты выяснили, что анализ средовой ДНК позволяет выявить больше организмов, чем изучение воды и почвы образцов под микроскопом. Особенность проекта в том, что он идет в мегаполисе с населением свыше 13 млн, а не в заповеднике. В первый год изучили 12 природоохранных территорий. Ученые взяли пробы воды и почвы, в которых искали гены антибиотикоустойчивости бактерий, чтобы создать геномную базу.

Главный итог — работающая система генетического мониторинга городских экосистем. В московской части «Лосиного Острова» выявили более 1,6 тыс. видов микроскопических эукариот, 276 видов микроводорослей в воде и 157 на коре деревьев.

В 2026 году проект расширили на водоемы. Специалисты взяли пробы в 15 водоемах «Лосиного Острова» и 17 точках в Кусково, Покровском-Стрешнево и Царицыно. Они станут постоянными станциями мониторинга. Полевой этап завершен, сейчас идет лабораторный. Данные занесли в единую карту, первые результаты ожидают в ближайшие месяцы.

Накопленная с 2025 года база станет основой для моделей прогнозирования цветения водоемов. Методику можно применять на других зеленых территориях и водоемах, для почвы и воздуха в Москве и других регионах.

Генетики работают с зоологами и гидробиологами. На тех же станциях собирают материал для классического учета, чтобы сверять находки и расхождения.

С 2025 года собирают справочную базу привязкой к карте местности, которая включила тысячи полных геномов, микроорганизмов и инвазивных видов, данные о генах устойчивости к антибиотикам.

Собранные данные помогают решить практические задачи, такие как предотвращение цветения и зарастания водоемов. Генетика замечает изменения цианобактерий и водорослей раньше видимых признаков. Кроме того, поиск генов устойчивости бактерий к антибиотикам помогает отличить бытовое загрязнение от биологического. Например, изменения состава микробного сообщества могут быть показателем вероятного нефтяного загрязнения.